課程資訊
課程名稱
冷凍電子顯微術:理論與實作(一)
Cryo-Electron Microscopy: theory and practice (I) 
開課學期
106-1 
授課對象
生命科學院  生化科學研究所  
授課教師
陳佩燁 
課號
BChem5042 
課程識別碼
B46EU1020 
班次
 
學分
2.0 
全/半年
半年 
必/選修
選修 
上課時間
 
上課地點
 
備註
本課程以英語授課。國際研究生學程選修課程。上課地點為中研院生化所102室,上課時間為每週三下午2:00~4:00。
總人數上限:20人 
 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

基於最近顯微鏡技術突破,冷凍電顯成為結構生物學主流。本課程將複習x光結晶學,及冷凍電顯沿革。 

課程目標
使學生能認識及使用冷凍電解,解決非晶態巨分子結構。
 
課程要求
Pre-requisite: General Physics(required), General Chemistry II (required), Fourier analysis or Fourier Optics (recommended), Signal Processing (recommended) 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
 
指定閱讀
待補 
參考書目
(1) Tony Crowther, The Resolution Revolution: Recent Advances In cryoEM (Methods in Enzymology) 1st Edition
(2) Joachim Frank, Three-Dimensional Electron Microscopy of Macromolecular Assemblies: Visualization of Biological Molecules in Their Native State 2nd Edition
 
評量方式
(僅供參考)
   
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
  Review on structure-and-function relationship 
第2週
  Review on how structure research has impacted life sciences 
第3週
  The field in biology that are being revolutionized by structures 
第4週
  Taking picture of a macromolecule: image or diffraction 
第5週
  Do we always need a crystal for X-ray diffraction? 
第6週
  The advantage of electrons over X-ray and the bad side  
第7週
  The radiation damage issue and the birth of cryo-EM 
第8週
  The milestones of cryo-EM over last 30 years 
第9週
  The phase contrast image formation and contrast transfer 
第10週
  Midterm 
第11週
  The reduction of contrast: charge-induced motion hypothesis 
第12週
  Direct electron camera: motion correction 
第13週
  Direct electron camera: DQE and Poisson noise 
第14週
  Harvesting information from noisy single particle images 
第15週
  Towards 3D reconstruction: Fourier-slice theorem 
第16週
  Image alignment, model bias, and maximum likelihood 
第17週
  What if there are multiple conformations? 
第18週
  Final exam